Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB3O75712 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB3O75712 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB3O75712 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB3O75712 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB3O75712 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB3O75712 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB3O75712 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB3O75712 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB3O75712 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB3O75712 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB3O75712 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB3O75712 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB3O75712 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB3O75712 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB3O75712 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB3O75712 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB3O75712 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB3O75712 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB3O75712 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB3O75712 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB3O75712 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB3O75712 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB3O75712 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB3O75712 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB3O75712 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB3O75712 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB3O75712 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB3O75712 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB3O75712 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB3O75712 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms