Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRGAP2O75044 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRGAP2O75044 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms