Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
ABCC9O60706 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCC9O60706 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC45.39■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
ABCC9O60706 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
ABCC9O60706 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms