Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IKBKBO14920 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms