Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GIPC1O14908 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIPC1O14908 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIPC1O14908 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms