Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP56O00567 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP56O00567 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP56O00567 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP56O00567 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP56O00567 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP56O00567 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP56O00567 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP56O00567 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP56O00567 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP56O00567 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP56O00567 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP56O00567 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP56O00567 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP56O00567 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP56O00567 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP56O00567 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP56O00567 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP56O00567 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP56O00567 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP56O00567 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP56O00567 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP56O00567 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP56O00567 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP56O00567 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms