Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
I3L4J1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
I3L4J1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
I3L4J1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
I3L4J1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
I3L4J1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
I3L4J1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
I3L4J1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
I3L4J1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
I3L4J1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
I3L4J1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
I3L4J1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
I3L4J1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
I3L4J1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
I3L4J1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
I3L4J1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
I3L4J1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
I3L4J1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
I3L4J1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
I3L4J1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
I3L4J1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
I3L4J1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
I3L4J1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
I3L4J1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
I3L4J1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
I3L4J1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
I3L4J1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
I3L4J1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
I3L4J1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
I3L4J1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms