Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IQCJ-SCHIP1C9J366 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms