Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRRM3A6NNA2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRRM3A6NNA2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms