Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms