Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PMF1-BGLAPU3KQ54 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMF1-BGLAPU3KQ54 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1-BGLAPU3KQ54 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1-BGLAPU3KQ54 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMF1-BGLAPU3KQ54 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1-BGLAPU3KQ54 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMF1-BGLAPU3KQ54 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PMF1-BGLAPU3KQ54 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMF1-BGLAPU3KQ54 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMF1-BGLAPU3KQ54 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms