Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y5

PEX16, Peroxisomal membrane protein PEX16, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX16Q9Y5Y5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX16Q9Y5Y5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX16Q9Y5Y5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX16Q9Y5Y5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX16Q9Y5Y5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX16Q9Y5Y5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX16Q9Y5Y5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX16Q9Y5Y5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX16Q9Y5Y5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX16Q9Y5Y5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX16Q9Y5Y5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX16Q9Y5Y5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX16Q9Y5Y5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX16Q9Y5Y5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX16Q9Y5Y5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PEX16Q9Y5Y5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PEX16Q9Y5Y5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX16Q9Y5Y5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX16Q9Y5Y5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PEX16Q9Y5Y5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PEX16Q9Y5Y5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PEX16Q9Y5Y5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PEX16Q9Y5Y5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX16Q9Y5Y5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms