Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX8Q9Y5X2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX8Q9Y5X2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX8Q9Y5X2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX8Q9Y5X2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX8Q9Y5X2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX8Q9Y5X2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX8Q9Y5X2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX8Q9Y5X2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX8Q9Y5X2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX8Q9Y5X2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX8Q9Y5X2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX8Q9Y5X2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX8Q9Y5X2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX8Q9Y5X2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX8Q9Y5X2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX8Q9Y5X2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX8Q9Y5X2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX8Q9Y5X2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX8Q9Y5X2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX8Q9Y5X2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX8Q9Y5X2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms