Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLF2Q9Y5W3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLF2Q9Y5W3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLF2Q9Y5W3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLF2Q9Y5W3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLF2Q9Y5W3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLF2Q9Y5W3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLF2Q9Y5W3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLF2Q9Y5W3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLF2Q9Y5W3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLF2Q9Y5W3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLF2Q9Y5W3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLF2Q9Y5W3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLF2Q9Y5W3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLF2Q9Y5W3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF2Q9Y5W3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF2Q9Y5W3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF2Q9Y5W3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF2Q9Y5W3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF2Q9Y5W3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF2Q9Y5W3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF2Q9Y5W3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF2Q9Y5W3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF2Q9Y5W3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF2Q9Y5W3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF2Q9Y5W3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLF2Q9Y5W3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms