Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ICE1Q9Y2F5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ICE1Q9Y2F5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ICE1Q9Y2F5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ICE1Q9Y2F5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ICE1Q9Y2F5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ICE1Q9Y2F5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ICE1Q9Y2F5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ICE1Q9Y2F5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ICE1Q9Y2F5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ICE1Q9Y2F5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ICE1Q9Y2F5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ICE1Q9Y2F5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ICE1Q9Y2F5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ICE1Q9Y2F5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ICE1Q9Y2F5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ICE1Q9Y2F5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ICE1Q9Y2F5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ICE1Q9Y2F5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ICE1Q9Y2F5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ICE1Q9Y2F5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ICE1Q9Y2F5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ICE1Q9Y2F5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ICE1Q9Y2F5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ICE1Q9Y2F5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ICE1Q9Y2F5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ICE1Q9Y2F5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ICE1Q9Y2F5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ICE1Q9Y2F5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ICE1Q9Y2F5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ICE1Q9Y2F5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ICE1Q9Y2F5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ICE1Q9Y2F5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ICE1Q9Y2F5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ICE1Q9Y2F5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ICE1Q9Y2F5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ICE1Q9Y2F5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ICE1Q9Y2F5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms