Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN8AQ9UQD0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN8AQ9UQD0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN8AQ9UQD0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN8AQ9UQD0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN8AQ9UQD0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN8AQ9UQD0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN8AQ9UQD0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN8AQ9UQD0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN8AQ9UQD0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN8AQ9UQD0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN8AQ9UQD0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN8AQ9UQD0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN8AQ9UQD0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN8AQ9UQD0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN8AQ9UQD0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN8AQ9UQD0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN8AQ9UQD0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN8AQ9UQD0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN8AQ9UQD0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN8AQ9UQD0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN8AQ9UQD0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN8AQ9UQD0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN8AQ9UQD0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN8AQ9UQD0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN8AQ9UQD0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN8AQ9UQD0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN8AQ9UQD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN8AQ9UQD0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN8AQ9UQD0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms