Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HPS5Q9UPZ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HPS5Q9UPZ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HPS5Q9UPZ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HPS5Q9UPZ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HPS5Q9UPZ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HPS5Q9UPZ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HPS5Q9UPZ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HPS5Q9UPZ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HPS5Q9UPZ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HPS5Q9UPZ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HPS5Q9UPZ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HPS5Q9UPZ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HPS5Q9UPZ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HPS5Q9UPZ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
HPS5Q9UPZ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HPS5Q9UPZ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HPS5Q9UPZ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HPS5Q9UPZ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
HPS5Q9UPZ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HPS5Q9UPZ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HPS5Q9UPZ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HPS5Q9UPZ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HPS5Q9UPZ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HPS5Q9UPZ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
HPS5Q9UPZ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HPS5Q9UPZ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HPS5Q9UPZ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HPS5Q9UPZ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HPS5Q9UPZ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HPS5Q9UPZ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HPS5Q9UPZ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HPS5Q9UPZ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HPS5Q9UPZ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HPS5Q9UPZ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HPS5Q9UPZ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HPS5Q9UPZ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HPS5Q9UPZ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HPS5Q9UPZ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HPS5Q9UPZ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HPS5Q9UPZ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HPS5Q9UPZ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
HPS5Q9UPZ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HPS5Q9UPZ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HPS5Q9UPZ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HPS5Q9UPZ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HPS5Q9UPZ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HPS5Q9UPZ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HPS5Q9UPZ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
HPS5Q9UPZ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
HPS5Q9UPZ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HPS5Q9UPZ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HPS5Q9UPZ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HPS5Q9UPZ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HPS5Q9UPZ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HPS5Q9UPZ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HPS5Q9UPZ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
HPS5Q9UPZ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms