Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNX4

WDR3, WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR3Q9UNX4 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 SLCO1A2-208ENST00000435179 562 ntTSL 46.93□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 SLCO1A2-210ENST00000450590 569 ntTSL 46.64□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 SLCO1A2-202ENST00000413682 543 ntTSL 46.36□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 SLCO1A2-217ENST00000544290 2382 ntTSL 26.32□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 ATF1-205ENST00000552510 549 ntTSL 56.01□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 RALGPS2-201ENST00000324778 906 ntTSL 55.41□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.92e-7■■■■■ 63.3
WDR3Q9UNX4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 62.7
WDR3Q9UNX4 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)21.42■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 62.7
WDR3Q9UNX4 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 215.01□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 62.7
WDR3Q9UNX4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 57.5
WDR3Q9UNX4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 57
WDR3Q9UNX4 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 57
WDR3Q9UNX4 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 57
WDR3Q9UNX4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.382e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.272e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 527.22■■□□□ 1.952e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)27.19■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.882e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 526.67■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 526.59■■□□□ 1.852e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-215ENST00000589536 546 ntTSL 325.57■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 525.26■■□□□ 1.632e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.62e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.472e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MMAB-207ENST00000541763 1252 ntTSL 324■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 OPLAH-201ENST00000527993 635 ntTSL 523.6■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 PAXIP1-204ENST00000457196 3990 ntTSL 523■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 222.51■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 522.49■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 322.38■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 EVI5-204ENST00000474806 525 ntTSL 321.86■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-221ENST00000593167 763 ntTSL 521.75■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 521.61■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-206ENST00000473439 638 ntTSL 221.21■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.09■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED26-205ENST00000600060 478 ntTSL 220.28■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 219.77■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 ANAPC2-207ENST00000495611 747 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 NTRK1-205ENST00000497019 2508 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-208ENST00000550946 1394 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MMAB-205ENST00000537496 1188 ntTSL 219.04■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MCM7-206ENST00000465688 481 ntTSL 319.01■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 518.89■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED26-204ENST00000598608 742 ntTSL 318.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 518.86■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 EIF5A2-202ENST00000460117 518 ntTSL 318.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MMAB-209ENST00000544051 1089 ntTSL 318.72■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 218.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 318.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 HSD17B8-204ENST00000469186 933 ntTSL 518.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 SOCS7-203ENST00000617360 2051 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 YJEFN3-202ENST00000458210 2785 ntTSL 218.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-212ENST00000532978 2489 ntTSL 218.37■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 55.4
Retrieved 100 of 1,750 protein–RNA pairs in 13.7 ms