Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM82

SPATA2, Spermatogenesis-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA2Q9UM82 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA2Q9UM82 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA2Q9UM82 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA2Q9UM82 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA2Q9UM82 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA2Q9UM82 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA2Q9UM82 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA2Q9UM82 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA2Q9UM82 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA2Q9UM82 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA2Q9UM82 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA2Q9UM82 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA2Q9UM82 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA2Q9UM82 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA2Q9UM82 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA2Q9UM82 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA2Q9UM82 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA2Q9UM82 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA2Q9UM82 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPATA2Q9UM82 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPATA2Q9UM82 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA2Q9UM82 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA2Q9UM82 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA2Q9UM82 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA2Q9UM82 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA2Q9UM82 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA2Q9UM82 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA2Q9UM82 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA2Q9UM82 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA2Q9UM82 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA2Q9UM82 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms