Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV0

MYO5B, Unconventional myosin-Vb, humanhuman

Predictions only

Length 1,848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5BQ9ULV0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
MYO5BQ9ULV0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
MYO5BQ9ULV0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
MYO5BQ9ULV0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
MYO5BQ9ULV0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
MYO5BQ9ULV0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
MYO5BQ9ULV0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
MYO5BQ9ULV0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
MYO5BQ9ULV0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
MYO5BQ9ULV0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
MYO5BQ9ULV0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
MYO5BQ9ULV0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
MYO5BQ9ULV0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
MYO5BQ9ULV0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
MYO5BQ9ULV0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
MYO5BQ9ULV0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
MYO5BQ9ULV0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
MYO5BQ9ULV0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
MYO5BQ9ULV0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
MYO5BQ9ULV0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
MYO5BQ9ULV0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
MYO5BQ9ULV0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
MYO5BQ9ULV0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
MYO5BQ9ULV0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
MYO5BQ9ULV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
MYO5BQ9ULV0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
MYO5BQ9ULV0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
MYO5BQ9ULV0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
MYO5BQ9ULV0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
MYO5BQ9ULV0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
MYO5BQ9ULV0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
MYO5BQ9ULV0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
MYO5BQ9ULV0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
MYO5BQ9ULV0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
MYO5BQ9ULV0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
MYO5BQ9ULV0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
MYO5BQ9ULV0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MYO5BQ9ULV0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MYO5BQ9ULV0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
MYO5BQ9ULV0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
MYO5BQ9ULV0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
MYO5BQ9ULV0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
MYO5BQ9ULV0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
MYO5BQ9ULV0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
MYO5BQ9ULV0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
MYO5BQ9ULV0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5BQ9ULV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MYO5BQ9ULV0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MYO5BQ9ULV0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
MYO5BQ9ULV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
MYO5BQ9ULV0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
MYO5BQ9ULV0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
MYO5BQ9ULV0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
MYO5BQ9ULV0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
MYO5BQ9ULV0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
MYO5BQ9ULV0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
MYO5BQ9ULV0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
MYO5BQ9ULV0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
MYO5BQ9ULV0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
MYO5BQ9ULV0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
MYO5BQ9ULV0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
MYO5BQ9ULV0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
MYO5BQ9ULV0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MYO5BQ9ULV0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
MYO5BQ9ULV0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
MYO5BQ9ULV0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
MYO5BQ9ULV0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
MYO5BQ9ULV0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
MYO5BQ9ULV0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
MYO5BQ9ULV0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
MYO5BQ9ULV0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
MYO5BQ9ULV0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
MYO5BQ9ULV0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
MYO5BQ9ULV0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms