Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC13A4Q9UKG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC13A4Q9UKG4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A4Q9UKG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A4Q9UKG4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A4Q9UKG4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC13A4Q9UKG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC13A4Q9UKG4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC13A4Q9UKG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC13A4Q9UKG4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A4Q9UKG4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A4Q9UKG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC13A4Q9UKG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC13A4Q9UKG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms