Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PUF60Q9UHX1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PUF60Q9UHX1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUF60Q9UHX1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUF60Q9UHX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUF60Q9UHX1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PUF60Q9UHX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUF60Q9UHX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUF60Q9UHX1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUF60Q9UHX1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PUF60Q9UHX1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PUF60Q9UHX1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PUF60Q9UHX1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PUF60Q9UHX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PUF60Q9UHX1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PUF60Q9UHX1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PUF60Q9UHX1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PUF60Q9UHX1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PUF60Q9UHX1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PUF60Q9UHX1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PUF60Q9UHX1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PUF60Q9UHX1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PUF60Q9UHX1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PUF60Q9UHX1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PUF60Q9UHX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PUF60Q9UHX1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PUF60Q9UHX1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PUF60Q9UHX1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PUF60Q9UHX1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PUF60Q9UHX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PUF60Q9UHX1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PUF60Q9UHX1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PUF60Q9UHX1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PUF60Q9UHX1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PUF60Q9UHX1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PUF60Q9UHX1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PUF60Q9UHX1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PUF60Q9UHX1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PUF60Q9UHX1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PUF60Q9UHX1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PUF60Q9UHX1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PUF60Q9UHX1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PUF60Q9UHX1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PUF60Q9UHX1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PUF60Q9UHX1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PUF60Q9UHX1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PUF60Q9UHX1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PUF60Q9UHX1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PUF60Q9UHX1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PUF60Q9UHX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PUF60Q9UHX1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PUF60Q9UHX1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUF60Q9UHX1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUF60Q9UHX1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PUF60Q9UHX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PUF60Q9UHX1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PUF60Q9UHX1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PUF60Q9UHX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PUF60Q9UHX1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PUF60Q9UHX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms