Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUFIP1Q9UHK0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUFIP1Q9UHK0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUFIP1Q9UHK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUFIP1Q9UHK0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUFIP1Q9UHK0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUFIP1Q9UHK0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUFIP1Q9UHK0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUFIP1Q9UHK0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUFIP1Q9UHK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUFIP1Q9UHK0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUFIP1Q9UHK0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUFIP1Q9UHK0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUFIP1Q9UHK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUFIP1Q9UHK0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms