Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUX4Q9UBX2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUX4Q9UBX2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUX4Q9UBX2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUX4Q9UBX2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUX4Q9UBX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUX4Q9UBX2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX4Q9UBX2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUX4Q9UBX2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUX4Q9UBX2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms