Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF9Q9P2J2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF9Q9P2J2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF9Q9P2J2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF9Q9P2J2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGSF9Q9P2J2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF9Q9P2J2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF9Q9P2J2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF9Q9P2J2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF9Q9P2J2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF9Q9P2J2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF9Q9P2J2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGSF9Q9P2J2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF9Q9P2J2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IGSF9Q9P2J2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IGSF9Q9P2J2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IGSF9Q9P2J2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IGSF9Q9P2J2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF9Q9P2J2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF9Q9P2J2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF9Q9P2J2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IGSF9Q9P2J2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IGSF9Q9P2J2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGSF9Q9P2J2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGSF9Q9P2J2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGSF9Q9P2J2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGSF9Q9P2J2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGSF9Q9P2J2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGSF9Q9P2J2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGSF9Q9P2J2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF9Q9P2J2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGSF9Q9P2J2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
IGSF9Q9P2J2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF9Q9P2J2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF9Q9P2J2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF9Q9P2J2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF9Q9P2J2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF9Q9P2J2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9Q9P2J2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF9Q9P2J2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF9Q9P2J2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IGSF9Q9P2J2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IGSF9Q9P2J2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF9Q9P2J2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF9Q9P2J2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF9Q9P2J2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGSF9Q9P2J2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGSF9Q9P2J2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IGSF9Q9P2J2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms