Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
USP35Q9P2H5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
USP35Q9P2H5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
USP35Q9P2H5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
USP35Q9P2H5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
USP35Q9P2H5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
USP35Q9P2H5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
USP35Q9P2H5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
USP35Q9P2H5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
USP35Q9P2H5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
USP35Q9P2H5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
USP35Q9P2H5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
USP35Q9P2H5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
USP35Q9P2H5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
USP35Q9P2H5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP35Q9P2H5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
USP35Q9P2H5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
USP35Q9P2H5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
USP35Q9P2H5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
USP35Q9P2H5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
USP35Q9P2H5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
USP35Q9P2H5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
USP35Q9P2H5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
USP35Q9P2H5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
USP35Q9P2H5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
USP35Q9P2H5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
USP35Q9P2H5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
USP35Q9P2H5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
USP35Q9P2H5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
USP35Q9P2H5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
USP35Q9P2H5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
USP35Q9P2H5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
USP35Q9P2H5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
USP35Q9P2H5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
USP35Q9P2H5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
USP35Q9P2H5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
USP35Q9P2H5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
USP35Q9P2H5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
USP35Q9P2H5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
USP35Q9P2H5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
USP35Q9P2H5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
USP35Q9P2H5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
USP35Q9P2H5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
USP35Q9P2H5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
USP35Q9P2H5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
USP35Q9P2H5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP35Q9P2H5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
USP35Q9P2H5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
USP35Q9P2H5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
USP35Q9P2H5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
USP35Q9P2H5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
USP35Q9P2H5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
USP35Q9P2H5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
USP35Q9P2H5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
USP35Q9P2H5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
USP35Q9P2H5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
USP35Q9P2H5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
USP35Q9P2H5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
USP35Q9P2H5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
USP35Q9P2H5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
USP35Q9P2H5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
USP35Q9P2H5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
USP35Q9P2H5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms