Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2L2Q9NZM6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2L2Q9NZM6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2L2Q9NZM6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2L2Q9NZM6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L2Q9NZM6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L2Q9NZM6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L2Q9NZM6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2L2Q9NZM6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2L2Q9NZM6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2L2Q9NZM6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2L2Q9NZM6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2L2Q9NZM6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2L2Q9NZM6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKD2L2Q9NZM6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2L2Q9NZM6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2L2Q9NZM6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2L2Q9NZM6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2L2Q9NZM6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2L2Q9NZM6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKD2L2Q9NZM6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKD2L2Q9NZM6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L2Q9NZM6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2L2Q9NZM6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L2Q9NZM6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms