Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOR4AQ9NXH8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOR4AQ9NXH8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOR4AQ9NXH8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOR4AQ9NXH8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOR4AQ9NXH8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOR4AQ9NXH8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOR4AQ9NXH8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOR4AQ9NXH8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOR4AQ9NXH8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOR4AQ9NXH8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TOR4AQ9NXH8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOR4AQ9NXH8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOR4AQ9NXH8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOR4AQ9NXH8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOR4AQ9NXH8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOR4AQ9NXH8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOR4AQ9NXH8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TOR4AQ9NXH8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOR4AQ9NXH8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOR4AQ9NXH8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOR4AQ9NXH8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOR4AQ9NXH8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOR4AQ9NXH8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOR4AQ9NXH8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOR4AQ9NXH8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOR4AQ9NXH8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOR4AQ9NXH8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TOR4AQ9NXH8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOR4AQ9NXH8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOR4AQ9NXH8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOR4AQ9NXH8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOR4AQ9NXH8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOR4AQ9NXH8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOR4AQ9NXH8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOR4AQ9NXH8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOR4AQ9NXH8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOR4AQ9NXH8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms