Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD1Q9NXG2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THUMPD1Q9NXG2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THUMPD1Q9NXG2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD1Q9NXG2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD1Q9NXG2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD1Q9NXG2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THUMPD1Q9NXG2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD1Q9NXG2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD1Q9NXG2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD1Q9NXG2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
THUMPD1Q9NXG2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THUMPD1Q9NXG2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD1Q9NXG2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THUMPD1Q9NXG2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THUMPD1Q9NXG2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THUMPD1Q9NXG2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD1Q9NXG2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD1Q9NXG2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THUMPD1Q9NXG2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THUMPD1Q9NXG2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THUMPD1Q9NXG2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THUMPD1Q9NXG2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THUMPD1Q9NXG2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD1Q9NXG2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THUMPD1Q9NXG2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THUMPD1Q9NXG2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD1Q9NXG2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms