Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NHP2Q9NX24 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NHP2Q9NX24 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NHP2Q9NX24 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NHP2Q9NX24 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHP2Q9NX24 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NHP2Q9NX24 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NHP2Q9NX24 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHP2Q9NX24 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NHP2Q9NX24 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NHP2Q9NX24 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NHP2Q9NX24 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NHP2Q9NX24 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHP2Q9NX24 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms