Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVA1

UQCC1, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC1Q9NVA1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC1Q9NVA1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC1Q9NVA1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC1Q9NVA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCC1Q9NVA1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCC1Q9NVA1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCC1Q9NVA1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCC1Q9NVA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UQCC1Q9NVA1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UQCC1Q9NVA1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCC1Q9NVA1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCC1Q9NVA1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UQCC1Q9NVA1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UQCC1Q9NVA1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCC1Q9NVA1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCC1Q9NVA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UQCC1Q9NVA1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UQCC1Q9NVA1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC1Q9NVA1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UQCC1Q9NVA1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms