Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00846Q9NV44 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00846Q9NV44 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00846Q9NV44 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00846Q9NV44 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00846Q9NV44 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00846Q9NV44 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00846Q9NV44 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00846Q9NV44 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00846Q9NV44 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00846Q9NV44 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00846Q9NV44 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms