Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCM2LQ9NUG4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCM2LQ9NUG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCM2LQ9NUG4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCM2LQ9NUG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCM2LQ9NUG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCM2LQ9NUG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCM2LQ9NUG4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCM2LQ9NUG4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCM2LQ9NUG4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCM2LQ9NUG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCM2LQ9NUG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCM2LQ9NUG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCM2LQ9NUG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCM2LQ9NUG4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCM2LQ9NUG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCM2LQ9NUG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCM2LQ9NUG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCM2LQ9NUG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCM2LQ9NUG4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCM2LQ9NUG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCM2LQ9NUG4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCM2LQ9NUG4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCM2LQ9NUG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCM2LQ9NUG4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCM2LQ9NUG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCM2LQ9NUG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCM2LQ9NUG4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCM2LQ9NUG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCM2LQ9NUG4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCM2LQ9NUG4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCM2LQ9NUG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCM2LQ9NUG4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms