Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KCND1Q9NSA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KCND1Q9NSA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCND1Q9NSA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
KCND1Q9NSA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KCND1Q9NSA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
KCND1Q9NSA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KCND1Q9NSA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KCND1Q9NSA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
KCND1Q9NSA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KCND1Q9NSA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KCND1Q9NSA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KCND1Q9NSA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KCND1Q9NSA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KCND1Q9NSA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KCND1Q9NSA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KCND1Q9NSA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KCND1Q9NSA2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KCND1Q9NSA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KCND1Q9NSA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KCND1Q9NSA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KCND1Q9NSA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KCND1Q9NSA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCND1Q9NSA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCND1Q9NSA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCND1Q9NSA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCND1Q9NSA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KCND1Q9NSA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCND1Q9NSA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KCND1Q9NSA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCND1Q9NSA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCND1Q9NSA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCND1Q9NSA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KCND1Q9NSA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KCND1Q9NSA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KCND1Q9NSA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCND1Q9NSA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms