Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFDN4Q9NQP4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFDN4Q9NQP4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFDN4Q9NQP4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFDN4Q9NQP4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFDN4Q9NQP4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PFDN4Q9NQP4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFDN4Q9NQP4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFDN4Q9NQP4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFDN4Q9NQP4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFDN4Q9NQP4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFDN4Q9NQP4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PFDN4Q9NQP4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PFDN4Q9NQP4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFDN4Q9NQP4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFDN4Q9NQP4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFDN4Q9NQP4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFDN4Q9NQP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFDN4Q9NQP4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFDN4Q9NQP4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFDN4Q9NQP4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFDN4Q9NQP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFDN4Q9NQP4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFDN4Q9NQP4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFDN4Q9NQP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PFDN4Q9NQP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PFDN4Q9NQP4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PFDN4Q9NQP4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PFDN4Q9NQP4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PFDN4Q9NQP4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PFDN4Q9NQP4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFDN4Q9NQP4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFDN4Q9NQP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFDN4Q9NQP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFDN4Q9NQP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFDN4Q9NQP4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms