Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7M9

VSIR, V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIRQ9H7M9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIRQ9H7M9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIRQ9H7M9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIRQ9H7M9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIRQ9H7M9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIRQ9H7M9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIRQ9H7M9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIRQ9H7M9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIRQ9H7M9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSIRQ9H7M9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIRQ9H7M9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIRQ9H7M9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VSIRQ9H7M9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSIRQ9H7M9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSIRQ9H7M9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSIRQ9H7M9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSIRQ9H7M9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VSIRQ9H7M9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VSIRQ9H7M9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms