Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCX3BQ9H321 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCX3BQ9H321 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCX3BQ9H321 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
VCX3BQ9H321 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCX3BQ9H321 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCX3BQ9H321 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCX3BQ9H321 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCX3BQ9H321 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCX3BQ9H321 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCX3BQ9H321 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCX3BQ9H321 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCX3BQ9H321 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCX3BQ9H321 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCX3BQ9H321 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCX3BQ9H321 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCX3BQ9H321 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCX3BQ9H321 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCX3BQ9H321 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCX3BQ9H321 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCX3BQ9H321 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCX3BQ9H321 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCX3BQ9H321 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCX3BQ9H321 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCX3BQ9H321 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCX3BQ9H321 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCX3BQ9H321 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCX3BQ9H321 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCX3BQ9H321 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCX3BQ9H321 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCX3BQ9H321 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCX3BQ9H321 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCX3BQ9H321 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCX3BQ9H321 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCX3BQ9H321 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCX3BQ9H321 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCX3BQ9H321 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCX3BQ9H321 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms