Protein–RNA interactions for Protein: Q9H172

ABCG4, ATP-binding cassette sub-family G member 4, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG4Q9H172 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCG4Q9H172 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCG4Q9H172 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCG4Q9H172 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCG4Q9H172 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCG4Q9H172 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCG4Q9H172 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCG4Q9H172 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCG4Q9H172 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCG4Q9H172 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCG4Q9H172 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCG4Q9H172 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCG4Q9H172 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCG4Q9H172 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCG4Q9H172 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCG4Q9H172 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCG4Q9H172 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCG4Q9H172 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCG4Q9H172 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCG4Q9H172 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCG4Q9H172 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCG4Q9H172 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCG4Q9H172 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCG4Q9H172 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCG4Q9H172 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCG4Q9H172 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCG4Q9H172 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCG4Q9H172 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCG4Q9H172 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCG4Q9H172 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCG4Q9H172 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCG4Q9H172 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCG4Q9H172 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCG4Q9H172 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCG4Q9H172 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms