Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV3

SLC5A7, High affinity choline transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A7Q9GZV3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A7Q9GZV3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A7Q9GZV3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A7Q9GZV3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A7Q9GZV3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A7Q9GZV3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A7Q9GZV3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A7Q9GZV3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A7Q9GZV3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A7Q9GZV3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC5A7Q9GZV3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A7Q9GZV3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A7Q9GZV3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A7Q9GZV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A7Q9GZV3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A7Q9GZV3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A7Q9GZV3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A7Q9GZV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A7Q9GZV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A7Q9GZV3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms