Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSP1Q9GZU7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP1Q9GZU7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSP1Q9GZU7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSP1Q9GZU7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSP1Q9GZU7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSP1Q9GZU7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTDSP1Q9GZU7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSP1Q9GZU7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSP1Q9GZU7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTDSP1Q9GZU7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSP1Q9GZU7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSP1Q9GZU7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSP1Q9GZU7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSP1Q9GZU7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSP1Q9GZU7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms