Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC25A23Q9BV35 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC25A23Q9BV35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC25A23Q9BV35 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC25A23Q9BV35 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC25A23Q9BV35 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC25A23Q9BV35 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC25A23Q9BV35 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC25A23Q9BV35 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC25A23Q9BV35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC25A23Q9BV35 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC25A23Q9BV35 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC25A23Q9BV35 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC25A23Q9BV35 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC25A23Q9BV35 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC25A23Q9BV35 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC25A23Q9BV35 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC25A23Q9BV35 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC25A23Q9BV35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC25A23Q9BV35 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC25A23Q9BV35 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC25A23Q9BV35 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC25A23Q9BV35 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC25A23Q9BV35 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC25A23Q9BV35 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC25A23Q9BV35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC25A23Q9BV35 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC25A23Q9BV35 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC25A23Q9BV35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC25A23Q9BV35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC25A23Q9BV35 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC25A23Q9BV35 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC25A23Q9BV35 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC25A23Q9BV35 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC25A23Q9BV35 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC25A23Q9BV35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC25A23Q9BV35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms