Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB6Q9BUF5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB6Q9BUF5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB6Q9BUF5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB6Q9BUF5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB6Q9BUF5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB6Q9BUF5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB6Q9BUF5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB6Q9BUF5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBB6Q9BUF5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB6Q9BUF5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB6Q9BUF5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB6Q9BUF5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB6Q9BUF5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBB6Q9BUF5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB6Q9BUF5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TUBB6Q9BUF5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBB6Q9BUF5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBB6Q9BUF5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB6Q9BUF5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB6Q9BUF5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB6Q9BUF5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB6Q9BUF5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB6Q9BUF5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB6Q9BUF5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBB6Q9BUF5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBB6Q9BUF5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms