Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHCHD5Q9BSY4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD5Q9BSY4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD5Q9BSY4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD5Q9BSY4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHCHD5Q9BSY4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD5Q9BSY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHCHD5Q9BSY4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD5Q9BSY4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD5Q9BSY4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHCHD5Q9BSY4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD5Q9BSY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD5Q9BSY4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms