Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP3BQ9BS92 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP3BQ9BS92 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP3BQ9BS92 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3BQ9BS92 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3BQ9BS92 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3BQ9BS92 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3BQ9BS92 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3BQ9BS92 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms