Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM9SF2Q99805 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM9SF2Q99805 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM9SF2Q99805 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM9SF2Q99805 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF2Q99805 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF2Q99805 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM9SF2Q99805 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM9SF2Q99805 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM9SF2Q99805 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM9SF2Q99805 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM9SF2Q99805 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM9SF2Q99805 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF2Q99805 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM9SF2Q99805 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF2Q99805 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF2Q99805 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF2Q99805 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM9SF2Q99805 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM9SF2Q99805 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF2Q99805 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM9SF2Q99805 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM9SF2Q99805 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF2Q99805 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM9SF2Q99805 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF2Q99805 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF2Q99805 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM9SF2Q99805 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM9SF2Q99805 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM9SF2Q99805 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM9SF2Q99805 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM9SF2Q99805 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms