Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SECISBP2Q96T21 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SECISBP2Q96T21 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SECISBP2Q96T21 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SECISBP2Q96T21 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SECISBP2Q96T21 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SECISBP2Q96T21 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SECISBP2Q96T21 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SECISBP2Q96T21 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SECISBP2Q96T21 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SECISBP2Q96T21 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SECISBP2Q96T21 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SECISBP2Q96T21 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SECISBP2Q96T21 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SECISBP2Q96T21 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SECISBP2Q96T21 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SECISBP2Q96T21 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SECISBP2Q96T21 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SECISBP2Q96T21 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SECISBP2Q96T21 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SECISBP2Q96T21 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SECISBP2Q96T21 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SECISBP2Q96T21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SECISBP2Q96T21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SECISBP2Q96T21 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SECISBP2Q96T21 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SECISBP2Q96T21 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SECISBP2Q96T21 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SECISBP2Q96T21 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SECISBP2Q96T21 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms