Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT8L2Q96SF2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCT8L2Q96SF2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCT8L2Q96SF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT8L2Q96SF2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT8L2Q96SF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCT8L2Q96SF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT8L2Q96SF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCT8L2Q96SF2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT8L2Q96SF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCT8L2Q96SF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT8L2Q96SF2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT8L2Q96SF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT8L2Q96SF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT8L2Q96SF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT8L2Q96SF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT8L2Q96SF2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCT8L2Q96SF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT8L2Q96SF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT8L2Q96SF2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT8L2Q96SF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT8L2Q96SF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCT8L2Q96SF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCT8L2Q96SF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCT8L2Q96SF2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCT8L2Q96SF2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCT8L2Q96SF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT8L2Q96SF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCT8L2Q96SF2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCT8L2Q96SF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCT8L2Q96SF2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCT8L2Q96SF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCT8L2Q96SF2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCT8L2Q96SF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCT8L2Q96SF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCT8L2Q96SF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCT8L2Q96SF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCT8L2Q96SF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCT8L2Q96SF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCT8L2Q96SF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT8L2Q96SF2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT8L2Q96SF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT8L2Q96SF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT8L2Q96SF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT8L2Q96SF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT8L2Q96SF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT8L2Q96SF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT8L2Q96SF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT8L2Q96SF2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT8L2Q96SF2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCT8L2Q96SF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT8L2Q96SF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT8L2Q96SF2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT8L2Q96SF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms