Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPP1R9BQ96SB3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPP1R9BQ96SB3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPP1R9BQ96SB3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPP1R9BQ96SB3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPP1R9BQ96SB3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PPP1R9BQ96SB3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PPP1R9BQ96SB3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PPP1R9BQ96SB3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PPP1R9BQ96SB3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PPP1R9BQ96SB3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PPP1R9BQ96SB3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PPP1R9BQ96SB3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PPP1R9BQ96SB3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PPP1R9BQ96SB3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PPP1R9BQ96SB3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PPP1R9BQ96SB3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PPP1R9BQ96SB3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PPP1R9BQ96SB3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PPP1R9BQ96SB3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PPP1R9BQ96SB3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PPP1R9BQ96SB3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PPP1R9BQ96SB3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PPP1R9BQ96SB3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPP1R9BQ96SB3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PPP1R9BQ96SB3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPP1R9BQ96SB3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPP1R9BQ96SB3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPP1R9BQ96SB3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPP1R9BQ96SB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPP1R9BQ96SB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPP1R9BQ96SB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPP1R9BQ96SB3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPP1R9BQ96SB3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPP1R9BQ96SB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPP1R9BQ96SB3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPP1R9BQ96SB3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPP1R9BQ96SB3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PPP1R9BQ96SB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPP1R9BQ96SB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPP1R9BQ96SB3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPP1R9BQ96SB3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPP1R9BQ96SB3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPP1R9BQ96SB3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPP1R9BQ96SB3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPP1R9BQ96SB3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPP1R9BQ96SB3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PPP1R9BQ96SB3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPP1R9BQ96SB3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPP1R9BQ96SB3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPP1R9BQ96SB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPP1R9BQ96SB3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPP1R9BQ96SB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPP1R9BQ96SB3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPP1R9BQ96SB3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms