Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG3

TTC25, Tetratricopeptide repeat protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC25Q96NG3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC25Q96NG3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC25Q96NG3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC25Q96NG3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC25Q96NG3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC25Q96NG3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC25Q96NG3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC25Q96NG3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC25Q96NG3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC25Q96NG3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC25Q96NG3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC25Q96NG3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC25Q96NG3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC25Q96NG3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC25Q96NG3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC25Q96NG3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC25Q96NG3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC25Q96NG3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC25Q96NG3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC25Q96NG3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC25Q96NG3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC25Q96NG3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC25Q96NG3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC25Q96NG3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC25Q96NG3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC25Q96NG3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms