Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
EP400Q96L91 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
EP400Q96L91 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EP400Q96L91 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EP400Q96L91 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EP400Q96L91 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
EP400Q96L91 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
EP400Q96L91 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
EP400Q96L91 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
EP400Q96L91 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
EP400Q96L91 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
EP400Q96L91 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
EP400Q96L91 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
EP400Q96L91 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
EP400Q96L91 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
EP400Q96L91 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
EP400Q96L91 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
EP400Q96L91 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
EP400Q96L91 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
EP400Q96L91 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
EP400Q96L91 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
EP400Q96L91 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
EP400Q96L91 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
EP400Q96L91 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
EP400Q96L91 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
EP400Q96L91 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
EP400Q96L91 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
EP400Q96L91 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
EP400Q96L91 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
EP400Q96L91 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
EP400Q96L91 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
EP400Q96L91 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
EP400Q96L91 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
EP400Q96L91 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
EP400Q96L91 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
EP400Q96L91 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
EP400Q96L91 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
EP400Q96L91 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
EP400Q96L91 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
EP400Q96L91 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
EP400Q96L91 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
EP400Q96L91 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
EP400Q96L91 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
EP400Q96L91 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
EP400Q96L91 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
EP400Q96L91 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
EP400Q96L91 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
EP400Q96L91 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
EP400Q96L91 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
EP400Q96L91 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
EP400Q96L91 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
EP400Q96L91 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
EP400Q96L91 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
EP400Q96L91 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
EP400Q96L91 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
EP400Q96L91 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
EP400Q96L91 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
EP400Q96L91 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
EP400Q96L91 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
EP400Q96L91 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
EP400Q96L91 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EP400Q96L91 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EP400Q96L91 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EP400Q96L91 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EP400Q96L91 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EP400Q96L91 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
EP400Q96L91 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
EP400Q96L91 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EP400Q96L91 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EP400Q96L91 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EP400Q96L91 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EP400Q96L91 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
EP400Q96L91 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EP400Q96L91 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
EP400Q96L91 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EP400Q96L91 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EP400Q96L91 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EP400Q96L91 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EP400Q96L91 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EP400Q96L91 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms